Während ihres Cembalostudiums in Basel entdeckte Nathalie Leuenberger die Orgel. Da sie sich in Kirchen wohl fühlt, ihr Raum und die Atmosphäre ihr gefielen und sie auch zum Nachdenken anregten, war es bald klar, dass sie sich auf der Orgel weiterbilden wollte. Nach einem Weiterbildungsjahr in Amsterdam schloss sie 2008 mit einem Nachdiplomstudiengang in Strasbourg mit Diplom ab.